L'Eau (Water) est le fluide le plus répandu de Minecraft, apparaissant naturellement dans les océans, rivières, lacs, sources et nappes phréatiques souterraines de presque tous les biomes du monde principal. Le joueur récupère l'Eau avec un seau vide et place un bloc source n'importe où dans le monde principal, d'où l'Eau s'étend jusqu'à sept blocs à l'horizontale. Deux blocs sources placés en diagonale ou en carré 2×2 forment une source infinie, si bien qu'un petit bassin se remplit de lui-même. Dans le Nether, l'Eau s'évapore dès qu'elle est placée et ne peut être conservée que dans un chaudron.

L'Eau (Water) actionne de nombreuses mécaniques : elle irrigue les terres agricoles dans un rayon de quatre blocs pour accélérer la croissance des cultures, transporte objets et créatures le long de canaux, annule les dégâts de chute et éteint le feu. Associée au Sable des âmes (Soul Sand) ou à un Bloc de magma (Magma Block), l'Eau crée des ascenseurs à colonnes de bulles ascendants ou descendants, et lorsque l'Eau rencontre la lave courante, elle produit de la roche, de la pierre ou de l'obsidienne. Depuis la mise à jour Update Aquatic 1.13, de nombreux blocs comme les escaliers, dalles et clôtures peuvent être immergés, ce qui permet aux bâtisseurs d'intégrer l'Eau dans des constructions sous-marines et côtières détaillées.